进化的前提是变异，达尔文也正是看到这一点才想象出了进化的概念。《物种起源》的第一章就是从介绍“家养状况下的变异”开始的。在达尔文的时代，很多人喜欢训鸽。鸽子有很多种，样子也各不相同，但其实它们都是由野生岩鸽驯化而来的。也就是野生岩鸽产生了变异，形成了不同品种的新鸽子。其实，很多家畜和家禽都是用这种方式演化而来的。但问题的关键是这个过程是不是就是进化？显然答案是否定的，因为这个过程并没有体现出“先进”和“落后”的问题，野生岩鸽并没有显示出不适应环境的问题，它还是活蹦乱跳地在自然界中存在。它所产生的变异可能源自于基因突变，也可能是因为与不同类型的鸽子杂交而产生的新后代，不论哪种情况都与进化没有丝毫关系。更重要的是这些变化都统统是在鸽子这个物种范围内进行的，绝不会跨种进行。也就是鸽子再变异也不可能进化成为松鼠，这是由鸽子自身携带的遗传物质DNA决定的。

生物DNA直接掌控着每一种生命的三层信息，一是种属编码信息，用来区隔不同的物种，比如老虎、猩猩和人的种属编码信息完全不同；二是种内编码信息，用来区别同一物种之内不同亚种之间的差异，比如东北虎和华南虎、倭黑猩猩和黑猩猩、黑种人和白种人；三是种内非编码信息，影响物种个体之间的细微差别，比如同一家庭内兄弟姐妹之间长相的不同。编码信息具有遗传性，需要严格被锁定，不能轻易产生变异，这才能保证物种的稳定性，使得整个自然界不至于乱套；而非编码信息没有遗传性，可以产生变异，能引起外在形态的细微变化，但绝不会改变物种。瑞典生物学家林奈在他的《自然系统》一书中，将动物界分为哺乳、鸟、两栖、鱼、昆虫及蠕虫共六个纲。每个纲下面都由不同的物种构成，物种下面再细分为多个亚种。虽然这个分类不如现代生物的分类细致，但却比较简洁明了的分类，对非专业人士就已经够用了。纲与纲之间是绝对隔离的，也就是鱼不可能进化成两栖动物，而两栖动物也绝不可能进化成哺乳动物；而物种之间是基本隔离的，在哺乳纲下，每一个物种之间都有锁定的基因维持该物种稳定地遗传，在没有极端自然环境改变的条件下，羚羊永远是羚羊，它绝不可能进化为猎豹。

但在形状和习性相近的物种间可以通过杂交产生新物种，比如马和驴杂交可以产生变异，生出骡子，老虎和狮子也会生出虎狮，但这都不是常见现象，而且后代并不“先进”，甚至是有残缺，就像骡子都不能产生后代，所以，靠这种方式产生并延续新物种几乎是不可能的，也是没必要的。可见，变异是和进化毫不相关的，变异并不是物种的常态，适应环境的物种也不需要变异，只要它具有适应性，那它就会一直生存下去，这是自然界的规律；而不适应者就会被淘汰，这也是自然界的规律；唯独进化不是自然界的规律，它是人类给自然界强加的人为意志，生物不需要这个规律，它们至今还在暗暗地耻笑着人类这种自作多情。

关于人类的起源问题，实际上达尔文在他的《物种起源》一书中并没有详细论述。因为他当时的确对自己的“进化论”思想没有什么把握，而且涉及人的进化问题直接冲击他原先的《圣经》信仰。但当《物种起源》出版后，在社会上引起了意想不到的反响。尤其受到大量无神论者以及科学界人士的大加赞赏，而且他在书中说到最初的生命是通过造物主吹气的方式产生，这令有神论者也多少获得些安慰，所以最初的反对声还不那么强烈。达尔文自己也从这本书中获得了名利双收，于是就又蠢蠢欲动了。终于在年8月30日出版了《人类的起源》一书，很多人都不知道这本书，因为书的水平真的很差，全书有一半以上的篇幅是谈性选择理论，涉及到人类的那一部分篇幅较小，其中大部分还是讨论人种和人种借助性选择而产生的问题，真正谈整个人类起源的问题只是寥寥数笔。这本书着实成了一本挂羊头卖狗肉的伪科学著作，因为他的性选择理论简直就是毫无根据地猜想，主要就是在阐述为什么自然界的雄性动物都特别漂亮，比如雄孔雀有能开屏的长尾巴，而雌孔雀就什么也没有，显得很土气。达尔文解释说，这也是自然选择的结果，长尾巴的雄孔雀更容易得到雌孔雀的欢心，所以就存留了下来，并繁衍了后代，而短尾巴的雄孔雀找不到配偶，就慢慢被淘汰掉了。这是多么奇葩的“科学理论”啊，毫无逻辑，前后矛盾。

达尔文认为自己的“进化论”是万能的，什么现象都能解释，但这种牵强附会的解释，反倒让人们怀疑“进化论”的可靠性。达尔文没有现代基因学的知识，根本不知道是因为基因的不同，才导致了雌雄的性状不同，这与“进化论”八竿子都打不着。这就像解释长颈鹿总吃高树上的叶子后脖子就慢慢变长一样可笑，这种通过外在锻炼产生的变化能改变内在基因吗？它的后代怎么能继承它的长脖子性状呢？练健美的肌肉男的后代出生就是肌肉婴儿吗？这显然是不可能的，虽然达尔文在书中提出了人类起源于猿猴，但这似乎已经不重要了，性选择理论已经让这本书失去了人心，而且把猿猴当成人的祖先，还彻底激怒了有神论者，他们大骂达尔文玷污了人类，并从此对“进化论”正式宣战。